C = Atom('C')
C_alpha = Atom('CH2')
H_1 = Atom('H')
H_2 = Atom('H')
H_3 = Atom('H')
N = Atom('N')
O = Atom('O')

bonds = [Bond(N, H_1), Bond(N, H_2), Bond(N, H_3), Bond(N, C_alpha), Bond(C_alpha, C), Bond(C, O), ]

pdbmap = [('', {'N': N, 'O': O, 'CA': C_alpha, '1HT': H_1, 'HN2': H_2, 'HN3': H_3, 'C': C, }, ), ]

pdb_alternative = {'HT1': '1HT', 'HT2': '2HT', 'HT3': '3HT', 'H1': '1HT', 'H3': '3HT', 'H2': '2HT', 'HN1': '1HT', 'HN2': '2HT', 'HN3': '3HT', '1HN': '1HT', '2HN': '2HT', '3HN': '3HT' }

name = 'peptide N terminus'

opls_atom_type = {N: 'N3', H_1: 'H3', H_2: 'H3', H_3: 'H3', C_alpha: 'CQ', C: 'C', O: 'O',  }

opls_charge = {N: -0.30, H_1: 0.33, H_2: 0.33, H_3: 0.33, C_alpha: 0.31, C: 0.5, O: -0.5,  }
